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【基础信息】
- **资源名称**：【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 带源码课件
- **资源大小**：73.7G
- **文件数量**：312
- **适用人群**：自学/提升/教学参考

【内容简介】
总计: 60 个文件夹, 252 个文件

【目录清单】

├──  01生物信息入门
│ └──  01生物信息入门.mp4
├──  02Linux基础
│ ├──  02Linux介绍.mp4
│ ├──  03Linux基础.mp4
│ ├──  04目录结构.mp4
│ ├──  05文件操作1.mp4
│ ├──  06文件操作2.mp4
│ ├──  07编辑脚本.mp4
│ └──  08权限和任务管理.mp4
├──  03生物软件及数据库
│ ├──  09生物软件简介.mp4
│ ├──  10安装已编译软件.mp4
│ ├──  11源代码编译.mp4
│ ├──  12环境配置.mp4
│ ├──  13bioconda.mp4
│ ├──  14腾讯云安装软件.mp4
│ ├──  15虚拟环境.mp4
│ └──  16生物数据库管理.mp4
├──  04illumina测序原理及数据处理
│ ├──  17测序数据下载.mp4
│ ├──  18了解测序这件事.mp4
│ ├──  19illumina测序原理之建库.mp4
│ ├──  20illumina测序原理之测序.mp4
│ ├──  21fastq文件介绍.mp4
│ ├──  22fastq文件处理.mp4
│ └──  23数据质控和过滤.mp4
├──  05pacbio测序原理及数据处理
│ ├──  24pacbio测序原理.mp4
│ └──  25pacbio数据处理.mp4
├──  06nanopore测序原理及数据处理
│ ├──  26nanopore测序原理.mp4
│ ├──  27碱基识别.mp4
│ └──  28nanopore数据处理.mp4
├──  07解决软件报错
│ └──  29解决软件报错.mp4
├──  08新冠病毒数据分析
│ ├──  30新冠病毒测序.mp4
│ ├──  31下载新冠病毒基因组序列.mp4
│ ├──  32下载新冠分析数据库.mp4
│ ├──  33新冠病毒快速鉴定.mp4
│ ├──  34新冠参考基因组拼接.mp4
│ ├──  35新冠病毒拼接结果验证.mp4
│ ├──  36拼接新冠病毒基因组.mp4
│ └──  37ArticNetWork流程.mp4
├──  09构建系统发育树
│ ├──  38构建系统发育树.mp4
│ ├──  39iTol美化系统发育树.mp4
│ └──  40变种病毒识别.mp4
├──  10二代基因组拼接
│ ├──  41了解基因组拼接.mp4
│ ├──  42基因组拼接原理.mp4
│ ├──  43kmer估计基因组大小.mp4
│ ├──  44二代测序拼接算法.mp4
│ └──  45二代测序拼接实战.mp4
├──  11拼接结果统计及评估
│ ├──  46fasta格式文件介绍与处理.mp4
│ ├──  47quast评估.mp4
│ ├──  48busco评估.mp4
│ └──  49tablet以及bandage评估.mp4
├──  12基因组拼接探索
│ ├──  50基因组拼接探索.mp4
│ └──  51混合拼接.mp4
├──  13三代测序基因组拼接
│ ├──  52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4
│ ├──  53组装结果纠错.mp4
│ ├──  54细菌完成图.mp4
│ └──  55不同物种拼接练习.mp4
├──  14基因组序列分析
│ ├──  56原核生物基因预测.mp4
│ ├──  57真核生物基因预测.mp4
│ ├──  58基因功能注释.mp4
│ ├──  59ncRNA分析.mp4
│ └──  60重复序列分析.mp4
├──  15序列比对
│ ├──  61blast比对.mp4
│ ├──  62blast使用案例.mp4
│ └──  63全局比对.mp4
├──  16共线性分析
│ ├──  64共线性分析.mp4
│ └──  65MCScanX共线性分析.mp4
├──  17基因家族分析
│ └──  66基因家族分析.mp4
├──  18测序数据比对
│ ├──  67测序数据比对.mp4
│ ├──  68段序列比对练习.mp4
│ ├──  69长读长序列比对.mp4
│ └──  70多重比对问题如何处理.mp4
├──  19sam和bam文件处理
│ ├──  71sam和bam格式文件介绍.mp4
│ ├──  72sam和bam处理案例（上）.mp4
│ └──  73sam和bam处理案例（下）.mp4
├──  20Linux高级操作
│ ├──  74生物信息常用文件格式.mp4
│ ├──  75正则表达式.mp4
│ ├──  76文件搜索.mp4
│ ├──  77文本筛选grep.mp4
│ └──  78文本编辑.mp4
├──  21表格处理
│ ├──  79cut-sort-uniq.mp4
│ ├──  80表格处理awk.mp4
│ ├──  81bioawk.mp4
│ ├──  82csvtk.mp4
│ └──  83datamash.mp4
├──  22shell编程
│ ├──  84shell变量.mp4
│ ├──  85shell循环.mp4
│ └──  86shell判断.mp4
├──  23生物信息分析服务器简介
│ ├──  87服务器简介.mp4
│ ├──  88硬件选购.mp4
│ ├──  89安装操作系统.mp4
│ ├──  90选择RAID.mp4
│ ├──  91设置云服务器.mp4
│ ├──  92yum工具.mp4
│ └──  93磁盘操作.mp4
├──  24生物信息分析平台搭建
│ ├──  100配置R语言分析环境.mp4
│ ├──  101安装网络应用.mp4
│ ├──  94基础环境配置.mp4
│ ├──  95升级centos-stream.mp4
│ ├──  96重置服务器练习.mp4
│ ├──  97用户管理.mp4
│ ├──  98配置生物软件.mp4
│ └──  99配置生物数据库.mp4
├──  25ubuntu系统配置
│ ├──  102ubuntu系统配置.mp4
│ └──  103虚拟机安装ubuntu.mp4
├──  26R语言基础入门
│ ├──  104R语言简介.mp4
│ ├──  105R语言以及Rstudio安装.mp4
│ ├──  106rstudio设置.mp4
│ ├──  107开始使用R.mp4
│ ├──  108R环境设置.mp4
│ ├──  109R包管理.mp4
│ └──  110文件操作.mp4
├──  27R数据结构
│ ├──  111向量.mp4
│ ├──  112向量索引.mp4
│ ├──  113矩阵.mp4
│ ├──  114数据框.mp4
│ └──  115因子列表缺失数据.mp4
├──  28R数据处理
│ ├──  116数据处理.mp4
│ ├──  117数据转换.mp4
│ ├──  118随机抽样以及数据探索.mp4
│ ├──  119分组计算以及数据透视表.mp4
│ ├──  120tidyverse.mp4
│ └──  121dplyr数据处理.mp4
├──  29R统计检验
│ ├──  122独立性卡方检验.mp4
│ ├──  123独立性t检验.mp4
│ └──  124相关性检验.mp4
├──  30R统计建模
│ ├──  125统计建模.mp4
│ ├──  126购物篮分析.mp4
│ └──  127机器学习预测乳腺癌.mp4
├──  31R基础绘图
│ ├──  128R语言技巧.mp4
│ ├──  129R基础绘图.mp4
│ ├──  130直方图.mp4
│ ├──  131饼图以及扇形图.mp4
│ ├──  132条形图以及分组条形图.mp4
│ ├──  133箱线图以及小提琴图.mp4
│ ├──  134韦恩图.mp4
│ └──  135绘图布局.mp4
├──  32ggplot2绘图
│ ├──  136ggplot2绘图.mp4
│ ├──  137ggplot2散点图直方图条形图.mp4
│ ├──  138ggplot2分组条形图以及箱线图.mp4
│ ├──  139ggplot2小提琴图以及主题设置.mp4
│ ├──  140ggplot2扩展.mp4
│ └──  141科学文献绘图.mp4
├──  33基因表达调控简介
│ ├──  142基因表达调控.mp4
│ ├──  143GEO数据库简介.mp4
│ └──  144关于基因的概念.mp4
├──  34RNAseq概述
│ ├──  145RNAseq简介.mp4
│ ├──  146RNAseq原理.mp4
│ ├──  147RNAseq建库方法.mp4
│ ├──  148RNAseq不同测序平台比较.mp4
│ └──  149RNAseq定量方法.mp4
├──  35RNAseq分析
│ ├──  150RNAseq分析环境搭建.mp4
│ ├──  151Bioconductor.mp4
│ ├──  152下载参考序列.mp4
│ ├──  153下载练习数据.mp4
│ ├──  154数据质控过滤.mp4
│ ├──  155hisat2建立索引.mp4
│ ├──  156hisat2比对.mp4
│ ├──  157featureCounts计数.mp4
│ ├──  158STAR比对.mp4
│ └──  159HTSeq-count计数.mp4
├──  36利用R分析RNAseq数据
│ ├──  160DESeq2分析RNAseq数据.mp4
│ ├──  161DESeq2练习.mp4
│ ├──  162edgeR分析RNAseq数据.mp4
│ └──  163edgeR练习.mp4
├──  37差异表达基因注释以及富集分析
│ ├──  164差异表达基因功能注释.mp4
│ ├──  165富集分析.mp4
│ ├──  166注释富集练习.mp4
│ ├──  167非模式生物注释富集.mp4
│ └──  168GSEA分析.mp4
├──  38单细胞测序概述
│ ├──  169单细胞测序概述.mp4
│ ├──  170单细胞测序原理.mp4
│ └──  171_10xgenomics资源以及常见问题.mp4
├──  39单细胞测序数据分析
│ ├──  172单细胞分析环境搭建.mp4
│ ├──  173利用cellranger分析单细胞数据.mp4
│ ├──  174结果解读.mp4
│ ├──  175LoupeBrowser.mp4
│ └──  176_10x练习数据.mp4
├──  40利用Seurat分析单细胞数据
│ ├──  177安装Seurat.mp4
│ ├──  178Seurat读取数据.mp4
│ ├──  179质控过滤以及标准化.mp4
│ ├──  180聚类.mp4
│ ├──  181细胞亚群分类.mp4
│ ├──  182寻找marker基因以及细胞鉴定.mp4
│ └──  183Seurat练习.mp4
├──  43空间转录组
│ └──  192空间转录组.mp4
├──  44宏基因组简介
│ ├──  193宏基因组简介.mp4
│ └──  194宏基因组建库测序.mp4
├──  45宏基因组分析环境搭建
│ ├──  195宏基因组分析环境搭建.mp4
│ └──  196国内镜像下载宏基因组数据库.mp4
├──  46三代nanopore测

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